Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Nicn1Q9CQM0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nicn1Q9CQM0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms