Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med30Q9CQI9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Med30Q9CQI9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms