Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkp2Q9CQ73 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pkp2Q9CQ73 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pkp2Q9CQ73 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms