Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StambpQ9CQ26 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
StambpQ9CQ26 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms