Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnaseh2cQ9CQ18 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms