Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt88Q9CPR6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms