Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim26Q99PN3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim26Q99PN3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms