Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rrbp1Q99PL5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rrbp1Q99PL5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rrbp1Q99PL5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms