Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tsnaxip1Q99P25 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsnaxip1Q99P25 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms