Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad54l2Q99NG0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad54l2Q99NG0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rad54l2Q99NG0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rad54l2Q99NG0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rad54l2Q99NG0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms