Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b1Q99NB9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sf3b1Q99NB9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms