Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atoh8Q99NA2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atoh8Q99NA2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms