Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PccbQ99MN9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms