Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cstf3Q99LI7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms