Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnpo2Q99LG2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tnpo2Q99LG2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms