Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1aQ99L02 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms