Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Reep3Q99KK1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms