Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lims1Q99JW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms