Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apobec3Q99J72 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apobec3Q99J72 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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