Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sntg1Q925E1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sntg1Q925E1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms