Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim59Q922Y2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim59Q922Y2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms