Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TardbpQ921F2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TardbpQ921F2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms