Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrc49Q91YK0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc49Q91YK0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms