Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y10

Pcdhac1, Protocadherin alpha C1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhac1Q91Y10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pcdhac1Q91Y10 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcdhac1Q91Y10 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms