Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp4Q8VHC5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp4Q8VHC5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms