Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc71Q8VEG0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms