Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc3Q8VE80 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc3Q8VE80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms