Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rprd1aQ8VDS4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rprd1aQ8VDS4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms