Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc36Q8VBW8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttc36Q8VBW8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc36Q8VBW8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms