Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg10Q8R1P4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms