Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lin28aQ8K3Y3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms