Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casc3Q8K3W3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Casc3Q8K3W3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms