Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd2Q8K2Z4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ncapd2Q8K2Z4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms