Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Paf1Q8K2T8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Paf1Q8K2T8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms