Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nek9Q8K1R7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nek9Q8K1R7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms