Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sde2Q8K1J5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sde2Q8K1J5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms