Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cldn34c1Q8K193 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Cldn34c1Q8K193 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms