Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700001C19RikQ8K168 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700001C19RikQ8K168 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms