Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnka2ipQ8CH19 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Csnka2ipQ8CH19 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms