Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Klf17Q8CFA7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf17Q8CFA7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms