Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pramef8Q8CE24 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms