Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn5Q8CBA2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slfn5Q8CBA2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms