Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nhsl1Q8CAF4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms