Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cwc22Q8C5N3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cwc22Q8C5N3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms