Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Cldn17Q8BXA6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Cldn17Q8BXA6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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