Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp38Q8BW70 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp38Q8BW70 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms