Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms