Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pbrm1Q8BSQ9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms