Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLQ7

Slc7a4, Cationic amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a4Q8BLQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc7a4Q8BLQ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc7a4Q8BLQ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms