Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms